Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfap2bQ61313 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2bQ61313 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2bQ61313 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms