Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AcanQ61282 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AcanQ61282 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AcanQ61282 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms