Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psen2Q61144 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psen2Q61144 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen2Q61144 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms