Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb3Q61087 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms