Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift20Q61025 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms