Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf3Q60980 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf3Q60980 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms