Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms