Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sik1Q60670 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sik1Q60670 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sik1Q60670 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms