Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2aQ60648 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms