Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr2f1Q60632 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr2f1Q60632 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr2f1Q60632 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms