Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A1cfQ5YD48 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A1cfQ5YD48 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A1cfQ5YD48 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms