Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf123Q5XPI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf123Q5XPI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf123Q5XPI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms