Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms