Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps54Q5SPW0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms