Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trav3-3Q5R1C3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav3-3Q5R1C3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms