Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SynaQ5G5D5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SynaQ5G5D5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SynaQ5G5D5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms