Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ecm2Q5FW85 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ecm2Q5FW85 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms