Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc47Q505F5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc47Q505F5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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