Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5935Q497S0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5935Q497S0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5935Q497S0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms