Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms