Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thsd4Q3UTY6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thsd4Q3UTY6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thsd4Q3UTY6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms