Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc190Q3URK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms