Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RprmlQ3URD2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RprmlQ3URD2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RprmlQ3URD2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms