Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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