Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmem253Q3UNB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Tmem253Q3UNB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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