Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog7Q3UM29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms