Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Greb1Q3UHK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Greb1Q3UHK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Greb1Q3UHK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms