Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed8Q3UHI4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed8Q3UHI4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed8Q3UHI4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms