Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms