Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc58Q3UGP9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms