Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LbrQ3U9G9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LbrQ3U9G9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms