Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms