Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd5Q3TYX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd5Q3TYX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd5Q3TYX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd5Q3TYX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smyd5Q3TYX3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd5Q3TYX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd5Q3TYX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd5Q3TYX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms