Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a5Q3TYU2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms