Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYE7

Tmem136, Transmembrane protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem136Q3TYE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem136Q3TYE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem136Q3TYE7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem136Q3TYE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem136Q3TYE7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms