Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms