Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp39Q3TIX9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp39Q3TIX9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms