Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prr27Q3SYJ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr27Q3SYJ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms