Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms