Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms