Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp8b1Q148W0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp8b1Q148W0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp8b1Q148W0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms