Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gli2Q0VGT2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gli2Q0VGT2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gli2Q0VGT2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms