Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ttc39dQ0VF76 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ttc39dQ0VF76 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ttc39dQ0VF76 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ttc39dQ0VF76 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ttc39dQ0VF76 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ttc39dQ0VF76 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc39dQ0VF76 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms