Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal1Q0VBP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms