Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt80Q0VBK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt80Q0VBK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt80Q0VBK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms