Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itgb8Q0VBD0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms