Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms