Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TrioQ0KL02 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TrioQ0KL02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms