Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Znf541Q0GGX2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Znf541Q0GGX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms