Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700061G19RikQ08EE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700061G19RikQ08EE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms